Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil3Q8K203 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neil3Q8K203 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Neil3Q8K203 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms