Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn7l2Q8C8K6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l2Q8C8K6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l2Q8C8K6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn7l2Q8C8K6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms