Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RtknQ8C6B2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtknQ8C6B2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RtknQ8C6B2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RtknQ8C6B2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RtknQ8C6B2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtknQ8C6B2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms