Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcfc2Q8BKT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gcfc2Q8BKT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcfc2Q8BKT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms