Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd2Q8BHD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd2Q8BHD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd2Q8BHD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd2Q8BHD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd2Q8BHD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd2Q8BHD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd2Q8BHD8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms