Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnot10Q8BH15 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot10Q8BH15 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot10Q8BH15 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot10Q8BH15 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms