Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim6Q8BGE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim6Q8BGE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim6Q8BGE7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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