Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp4aQ64436 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp4aQ64436 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp4aQ64436 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp4aQ64436 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms