Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl12Q62401 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl12Q62401 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl12Q62401 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms