Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ss18Q62280 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ss18Q62280 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ss18Q62280 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ss18Q62280 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ss18Q62280 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ss18Q62280 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms