Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyfip2Q5SQX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip2Q5SQX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip2Q5SQX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip2Q5SQX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms