Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx49Q4FZF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx49Q4FZF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx49Q4FZF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx49Q4FZF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms