Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UST5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UST5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UST5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UST5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UST5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UST5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UST5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UST5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UST5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UST5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UST5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UST5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UST5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UST5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UST5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UST5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UST5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UST5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UST5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UST5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UST5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UST5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UST5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UST5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UST5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UST5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UST5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UST5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UST5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UST5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UST5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UST5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UST5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UST5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UST5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UST5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UST5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UST5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UST5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q3UST5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UST5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UST5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UST5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UST5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UST5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UST5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UST5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UST5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UST5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UST5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UST5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UST5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UST5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UST5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UST5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UST5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UST5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UST5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UST5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UST5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UST5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UST5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UST5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UST5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UST5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms