Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pitpnm3Q3UHE1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitpnm3Q3UHE1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms