Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gse1Q3U3C9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gse1Q3U3C9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gse1Q3U3C9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms