Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 EHT1YBR177C 1356 nt7.98□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 TOK1YJL093C 2076 nt7.98□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 JHD1YER051W 1479 nt7.98□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 PET494YNR045W 1470 nt7.98□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 RCF1YML030W 480 nt7.97□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 HOS2YGL194C 1359 nt7.97□□□□□ -1.13
SVS1Q12254 EEB1YPL095C 1371 nt7.96□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 LRO1YNR008W 1986 nt7.95□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 YDR476CYDR476C 675 nt7.95□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 RMA1YKL132C 1293 nt7.95□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 MFG1YDL233W 1377 nt7.95□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 YJL107CYJL107C 1164 nt7.94□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 YJL211CYJL211C 444 nt7.94□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 HXT8YJL214W 1710 nt7.94□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 PSP2YML017W 1782 nt7.94□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 THI6YPL214C 1623 nt7.92□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 YGR137WYGR137W 375 nt7.92□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 YNR068CYNR068C 819 nt7.92□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 PET20YPL159C 762 nt7.92□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 NDE2YDL085W 1638 nt7.92□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 TRP2YER090W 1524 nt7.91□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 GNP1YDR508C 1992 nt7.9□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 BUD31YCR063W 474 nt7.9□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 snR78snR78 87 nt7.9□□□□□ -1.14
SVS1Q12254 WSC3YOL105C 1671 nt7.89□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 NBA1YOL070C 1506 nt7.89□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 HAC1YFL031W 717 nt7.89□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 COX16YJL003W 357 nt7.89□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 IDP3YNL009W 1263 nt7.89□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 YLR072WYLR072W 2082 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 BAP3YDR046C 1815 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 PRE5YMR314W 705 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 CPT1YNL130C 1182 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 HIS3YOR202W 663 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 INO1YJL153C 1602 nt7.88□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 RSM23YGL129C 1353 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 ARG7YMR062C 1326 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 SPR1YOR190W 1338 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 RRT6YGL146C 936 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 Q0144Q0144 330 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 TDA4YJR116W 840 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 YMR147WYMR147W 672 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 ATG22YCL038C 1587 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 FET5YFL041W 1869 nt7.87□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 APM1YPL259C 1428 nt7.86□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 SCO2YBR024W 906 nt7.86□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 DIP5YPL265W 1827 nt7.85□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 HXT11YOL156W 1704 nt7.85□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 PNS1YOR161C 1620 nt7.85□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 APT1YML022W 564 nt7.84□□□□□ -1.15
SVS1Q12254 YGL118CYGL118C 438 nt7.83□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 UFD1YGR048W 1086 nt7.83□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 LEA1YPL213W 717 nt7.83□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 SDH8YBR269C 417 nt7.83□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 TGL5YOR081C 2250 nt7.82□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 HOG1YLR113W 1308 nt7.82□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 PIC2YER053C 903 nt7.82□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 YLR358CYLR358C 564 nt7.82□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 PZF1YPR186C 1290 nt7.82□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 GLY1YEL046C 1164 nt7.81□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 NAT5YOR253W 531 nt7.81□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 ALR1YOL130W 2580 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 ABP1YCR088W 1779 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 YDR509WYDR509W 348 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 INM1YHR046C 888 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 URE2YNL229C 1065 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 FIT1YDR534C 1587 nt7.8□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 LPD1YFL018C 1500 nt7.79□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 YNL140CYNL140C 570 nt7.79□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 TIF3YPR163C 1311 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 ARO3YDR035W 1113 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 MRP7YNL005C 1116 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 MNN9YPL050C 1188 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 ICE2YIL090W 1476 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 ALG7YBR243C 1347 nt7.78□□□□□ -1.16
SVS1Q12254 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.77□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 SNP1YIL061C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 MIM1YOL026C 342 nt7.76□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 MOD5YOR274W 1287 nt7.76□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 SRM1YGL097W 1449 nt7.76□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 YBL081WYBL081W 1107 nt7.75□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 WSC4YHL028W 1818 nt7.74□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 YEL074WYEL074W 339 nt7.74□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 CPR2YHR057C 618 nt7.74□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 HBS1YKR084C 1836 nt7.73□□□□□ -1.17
SVS1Q12254 MRN1YPL184C 1839 nt7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.5 ms