Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gli2Q0VGT2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Gli2Q0VGT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Gli2Q0VGT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gli2Q0VGT2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gli2Q0VGT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gli2Q0VGT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Gli2Q0VGT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gli2Q0VGT2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Gli2Q0VGT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms