Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RelbQ04863 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelbQ04863 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelbQ04863 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelbQ04863 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelbQ04863 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelbQ04863 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelbQ04863 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RelbQ04863 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelbQ04863 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RelbQ04863 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelbQ04863 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms