Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6Q03468 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
ERCC6Q03468 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ERCC6Q03468 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ERCC6Q03468 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ERCC6Q03468 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms