Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Thbs2Q03350 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Thbs2Q03350 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thbs2Q03350 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms