Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gja5Q01231 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gja5Q01231 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gja5Q01231 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja5Q01231 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gja5Q01231 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms