Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf7Q00417 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf7Q00417 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf7Q00417 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf7Q00417 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf7Q00417 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms