Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh6P97326 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh6P97326 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh6P97326 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh6P97326 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh6P97326 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms