Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpcaP84075 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpcaP84075 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpcaP84075 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HpcaP84075 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpcaP84075 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpcaP84075 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HpcaP84075 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpcaP84075 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpcaP84075 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpcaP84075 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HpcaP84075 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpcaP84075 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms