Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP5EP56381 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP5EP56381 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP5EP56381 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms