Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1swP51491 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1swP51491 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1swP51491 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1swP51491 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1swP51491 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1swP51491 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1swP51491 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1swP51491 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1swP51491 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1swP51491 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1swP51491 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1swP51491 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1swP51491 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1swP51491 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1swP51491 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1swP51491 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1swP51491 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1swP51491 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1swP51491 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1swP51491 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn1swP51491 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn1swP51491 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms