Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ItgavP43406 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgavP43406 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgavP43406 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgavP43406 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgavP43406 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ItgavP43406 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ItgavP43406 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgavP43406 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgavP43406 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgavP43406 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgavP43406 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgavP43406 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgavP43406 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgavP43406 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgavP43406 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgavP43406 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgavP43406 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms