Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubl4aP21126 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubl4aP21126 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubl4aP21126 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubl4aP21126 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms