Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Csn1s1P19228 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Csn1s1P19228 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Csn1s1P19228 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms