Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ItgamP05555 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgamP05555 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ItgamP05555 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgamP05555 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgamP05555 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgamP05555 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgamP05555 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgamP05555 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ItgamP05555 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgamP05555 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgamP05555 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ItgamP05555 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgamP05555 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgamP05555 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms