Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3bO88509 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3bO88509 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3bO88509 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms