Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd2O35927 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnd2O35927 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnd2O35927 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd2O35927 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms