Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5849J3QPE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5849J3QPE5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5849J3QPE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5849J3QPE5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5849J3QPE5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5849J3QPE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5849J3QPE5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5849J3QPE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms