Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim55G3X8Y1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim55G3X8Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim55G3X8Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim55G3X8Y1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim55G3X8Y1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms