Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5145F8VQ88 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5145F8VQ88 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5145F8VQ88 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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