Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5218F6YH22 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5218F6YH22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5218F6YH22 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms