Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1700080E11RikE9Q9G1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700080E11RikE9Q9G1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700080E11RikE9Q9G1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700080E11RikE9Q9G1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700080E11RikE9Q9G1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms