Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm1141B9EJU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1141B9EJU1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1141B9EJU1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm1141B9EJU1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1141B9EJU1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms