Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld4A2A7W1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300ld4A2A7W1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300ld4A2A7W1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld4A2A7W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms