Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDK4Q16654 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDK4Q16654 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDK4Q16654 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK4Q16654 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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