Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms