Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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