Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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