Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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