Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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SHROOM2Q13796 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SHROOM2Q13796 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHROOM2Q13796 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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