Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ALCAMQ13740 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms