Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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