Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SGCGQ13326 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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