Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms