Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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HOXC10Q9NYD6 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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